Un desinfectante químico (CLORO, ÁLCALI, ALCALINO-ALCOHOL-AMINE…) sólo puede matar selectivamente uno o tipos similares de microorganismos patógenos.
Su tiempo de procesamiento es largo, en un rango de 0,5 – 1 hora debido a la baja tasa de reacción química y un valor de dosificación letal muy alto.
Implican una contaminación secundaria grave.
Su procesamiento letal se limita a la superficie de los objetos, por lo que es imposible de aplicar en grandes espacios de aire.